АО «Свердловская пригородная компания» образовано в соответствии с договором о создании общества от 20 июня 2005 года, Гражданским кодексом Российской Федерации, Федеральным законом «Об акционерных обществах», иными нормативными правовыми актами Российской Федерации.

28 июня 2005 года состоялась государственная регистрация ОАО «СПК», эта дата считается днем рождения компании.

В первые годы работы деятельность ОАО «СПК» заключалась в оказании аутсорсинговых услуг Свердловской железной дороге на основе заключенных договоров. 4 августа 2006 года компания получила лицензию на перевозку пассажиров и багажа железнодорожным транспортом. После получения лицензии была проведена серьезная подготовительная работа, необходимая для начала самостоятельной деятельности. В результате 1 октября 2008 года ОАО «СПК» получило статус полноправного перевозчика пассажиров в пригородном сообщении — компании переданы в управление пригородные поезда на полигоне Свердловской железной дороги — филиала ОАО «РЖД».

С 1 января 2011 года компания также является перевозчиком пассажиров на полигоне Южно-Уральской железной дороги — филиала ОАО «РЖД».